《內蒙古醫科大學學報》是由內蒙古醫科大學主管主辦的醫藥衛生綜合性學術期刊，于1959年創刊，系雙月刊，國內外公開發行,《內蒙古醫科大學學報》現為中國科技論文統計源期刊(中國科技論文核心期刊)（2008、2010、2011版科技論文統計源期刊目錄期刊），曾獲Caj-cd規范獲獎期刊獎，并被《中國科學引文數據庫》、《中文生物醫學期刊數據庫》、《中國學術期刊（光盤版）數據庫》、《中國學術期刊綜合評價數據庫》、 《中文科技期刊數據庫》、《中文科技資料目錄》、《全國報刊索引》、《中國藥學文摘》和《中國醫學文摘》（7個分冊）等國內外大型數據庫收錄。

《內蒙古醫科大學學報》主要刊載基礎醫學、臨床醫學、民族醫藥學、中醫中藥學、預防醫學等領域的最新研究成果、進展及科研動態。開辟有論著（基礎醫學、臨床醫學、預防醫學）、蒙醫藥論壇、技術與方法、經驗交流、短篇、綜述等欄目。