《中華胃腸外科雜志》我刊創辦于1998年5月，目前是我國惟一的胃腸外科專業學術期刊。本刊的主要讀者對象為普通外科和胃腸外科及相關專業臨床、科研、教學的高、中級醫師。辦刊宗旨是：在貫徹執行理論與實踐相結合、普及與提高相結合的方針，全面系統地反映國內外胃腸外科領域的學術動態，促進我國胃腸外科的學科發展和學術交流。

《中華胃腸外科雜志》設有專題述評、專題論壇、述評、專家筆談、專題論著、論著、臨床報道、病例報告、臨床思維與訓練、診治指南、文獻綜述、醫學信息等欄目；重點刊登胃腸外科及相關學科的主要研究成果和最新進展方面的文章；具有較高的學術權威性和一定的學術導向性。

《中華胃腸外科雜志》于2000年3月被吸收入國家科技部“中國科技論文統計源期刊”（中國科技核心期刊）；2005年3月又被國際上最具權威的生物醫學期刊數據庫——美國國立圖書館Medline數據庫收錄；2008年，又被北大圖書館收錄為臨床醫學核心期刊。同時，本刊還是《中國學術期刊（光盤版）》和中國期刊網全文數據庫收錄期刊，是中國學術期刊綜合評價數據庫來源期刊；同時被收錄為《中國核心期刊（遴選）數據庫》，還是《中國生物醫學核心期刊》；中文核心期刊(2008)。