《微生物與感染》為教育部主管、復旦大學主辦的學術類期刊，旨在建立一個學科間交叉﹑基礎聯系臨床和公共衛生預防的平臺，以利于傳播科研成果，培養學科人才和促進國內外學術交流。本刊內容涉及與人類、動物和植物感染相關的微生物，如病毒、細菌、真菌、立克次體、螺旋體、支原體等的生物學及分子生物學特性，抗感染免疫，實驗室診斷技術，臨床感染及流行病學與防疫等方面的研究。

《微生物與感染》2011年上海市期刊編校質量檢查中獲優秀獎。